Protein-protein interactions (PPIs) are highly specialised physical contacts made between two or more protein molecules as a result of biochemical processes influenced by interactions such as electrostatic forces, hydrogen bonds, and the hydrophobic effect. PPIs are complicated biological processes that are represented by the physical interactions between two or more proteins. They control a variety of biological processes, such as connections between cells and the regulation of metabolism and development. At particular binding domains on each protein, proteins bind to one another through a mix of hydrophobic bonding, van der Waals forces, and salt bridges. PPIs play crucial roles in all aspects of life, and abnormal PPIs have been linked to a number of illnesses, including cancer, infectious disorders, and neurodegenerative diseases. As a result, targeting PPIs is a path in illness treatment and a crucial method for creating new medications.
PPIs can be found using a variety of techniques, including in vivo ones, computational ones, and databases. Protein folding, protein assembly, and PPI are all based on noncovalent interactions between the side chains of the residues. Numerous interactions and connections between the proteins are brought about by these contacts. Numerous computational techniques to predict protein functions have been created thanks to the improved accessibility of PPI networks. Numerous computational approaches to predict protein activities have been developed as a result of the availability of trustworthy information on protein interactions and their involvement in physiological and pathological processes.
PPIs, which are physical interactions between two or more protein molecules, are essential to a number of biological processes. They can be found using a variety of methods, including computational and in vivo ones. One approach to treating diseases and a crucial method for creating novel medications is to target PPIs.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
Protein – Protein Etkileşimleri (PPI)
Protein-protein etkileşimleri (PPI'lar), biyokimyasal süreçlerin etkisiyle iki veya daha fazla protein molekülü arasında oluşan özel fiziksel bağlantılardır. Bu etkileşimler, elektrostatik kuvvetler, hidrojen bağları ve hidrofobik etki gibi etkileşimler tarafından yönlendirilir. PPI'lar, iki veya daha fazla protein arasındaki fiziksel etkileşimleri temsil eden karmaşık biyolojik süreçlerdir. Bu etkileşimler, hücreler arasındaki bağlantıları, metabolizma ve gelişimin düzenlenmesini kontrol eder. Proteinlerin belirli bağlanma bölgelerinde, hidrofobik bağlar, van der Waals kuvvetleri ve tuz köprüleri gibi bir kombinasyonla birbirlerine bağlanırlar. PPI'lar, hayatta her yönüyle önemli roller oynar ve anormal PPI'lar kanser, enfeksiyon hastalıkları ve nörodejeneratif hastalıklar gibi birçok hastalıkla ilişkilendirilmiştir. Bu nedenle, PPI'ları hedeflemek, hastalık tedavisinde bir yaklaşım ve yeni ilaçlar geliştirmek için kritik bir yöntemdir.
PPI'lar, in vivo deneyler, hesaplama temelli yöntemler ve veritabanları gibi çeşitli tekniklerle belirlenebilir. Protein katlanması, protein birleşimi ve PPI, kalıntıların yan zincirleri arasındaki kovalent olmayan etkileşimlere dayanır. Bu bağlantılar sayesinde proteinler arasında birçok etkileşim ve bağlantı meydana gelir. PPI ağlarının daha iyi erişilebilir hale gelmesiyle birlikte, protein fonksiyonlarını tahmin etmek için birçok hesaplama yöntemi geliştirilmiştir. Protein etkileşimleri ve bunların fizyolojik ve patolojik süreçlerdeki rolü hakkında güvenilir bilgilere sahip olunması, protein aktivitelerini tahmin etmek için birçok hesaplama yaklaşımının geliştirilmesini sağlamıştır.
PPI'lar, iki veya daha fazla protein molekülü arasındaki fiziksel etkileşimlerdir ve birçok biyolojik süreç için önemlidir. Hesaplama temelli ve in vivo gibi çeşitli yöntemlerle belirlenebilirler. PPI'ları hedeflemek, hastalıkların tedavisinde bir yaklaşım ve yeni ilaçlar geliştirmek için önemli bir yöntemdir.
ALEYNA KOLAK
Comments